Πολυετής είναι η παρουσία του Κέντρου Μικρασιατικών Σπουδών στον εκδοτικό χώρο. Από τις μονογραφίες τοπικής ιστορίας ή τις μελέτες για τα μικρασιατικά ιδιώματα έως τις προσφυγικές μαρτυρίες στην πεντάτομη Έξοδο του Μικρασιατικού ελληνισμού το ίδρυμα διέγραψε σταθερή πορεία.