Η γεωγραφία στάθηκε το βασικό εργαλείο για τη μελέτη της Μικράς Ασίας από την εποχή της ίδρυσης του Κέντρου Μικρασιατικών Σπουδών. Η Χαρτογραφική Υπηρεσία του Κέντρου που συστάθηκε το 1937  από την ίδια την Μέλπω Μερλιέ με την συμμετοχή ειδικού επιστημονικού προσωπικού, σχεδίασε και αρχειοθέτησε τους χάρτες ανά περιοχές. Εκτός από τα ανέκδοτα χειρόγραφα σκαριφήματα, που σχεδιάστηκαν κατά παραγγελία του Κέντρου Μικρασιατικών Σπουδών, υπάρχει στο Αρχείο και σημαντικός αριθμός έντυπων χαρτών.